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1.21.02
Optimierung der Diagnostik der meldepflichtigen Krebspest (Aphanomyces astaci) mittels Genotyping
Résumé
Krebspest, verursacht durch Aphanomyces astaci , ist für das Aussterben vieler einheimischer Flusskrebspopulationen in Europa verantwortlich. Die Krankheit ist in der Schweiz meldepflichtig. A. astaci wurde mit nordamerikanischen Krebsen, die keine Krankheitsanzeichen zeigen, eingeschleppt. Es werden fünf Genotypen (A-E) unterschieden, die bei europäischen Krebsen eine unterschiedliche Virulenz aufweisen. Die derzeit am FIWI angewandte Diagnostik ist in ihrer Sensitivität begrenzt und kann nicht zwischen Genotypen unterscheiden. Eine neu entwickelte Methode hat nun das Potenzial, die Sensitivität zu steigern und eine Genotypisierung zu ermöglichen. Ziel des vorgeschlagenen Projekts ist somit die Optimierung / Ergänzung der derzeit am FIWI angewandten Diagnostik durch Etablierung modernster Methoden zur Identifizierung von A. astaci -Genotypen. Das Wissen über Verteilung von Genotypen wird zum Verständnis von Verbreitungsszenarien beitragen und Vorhersagen über mögliche Ausbrüche, deren Folgen und eine molekulare Epidemiologie der Krankheit in der Schweiz ermöglichen.
Textes supplémentaires
Abstract
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Projektziele
Schlüsselwörter
Krebspest, Meldepflichtige Seuche, Schweiz, real-time PCR, Genotypisierung, Nanopore basierte Sequenzierung, eDNA, Populationsdynamik
Participants
Heike Schmidt-Posthaus
Hauptgesuchstellung
heike.schmidt@unibe.ch
Centre for Fish and Wildlife Health Department of Infectious Diseases and Pathobiology Heike Schmidt-Posthaus Länggasstrasse 122 3012 Bern BE CH
Gary Delalay
Kontaktperson
gary.delalay@blv.admin.ch
Bundesamt f. Lebensmittelsicherheit und Veterinärwesen Gary Delalay Schwarzenburgstr. 155 3003 Bern BE CH
Irene Adrian-Kalchhauser
Mitgesuchstellung
Irene.adrian-kalchhauser@vetsuisse.unibe.ch
Centre for Fish and Wildlife Health Department of Infectious Diseases and Pathobiology Irene Adrian-Kalchhauser Länggasstrasse 122 3012 Bern BE CH
Détails du projet
- Office de recherche
- BLV
- Statut du projet
- Abgeschlossen
- Type de projet
- Forschungsprojekt
- Date de début
- 2021-02-28
- Date de fin
- 2023-04-29
- Coûts totaux approuvés
- -
- Section
- Tiergesundheit, Zoonosen
- Domaine politique NABS
- Landwirtschaftliche Produktivität und Technologie
Labels
Disciplines de recherche
- B725 Diagnostics 100.0%