Optimierung der Diagnostik der meldepflichtigen Krebspest (Aphanomyces astaci) mittels Genotyping

Résumé

Krebspest, verursacht durch Aphanomyces astaci , ist für das Aussterben vieler einheimischer Flusskrebspopulationen in Europa verantwortlich. Die Krankheit ist in der Schweiz meldepflichtig. A. astaci wurde mit nordamerikanischen Krebsen, die keine Krankheitsanzeichen zeigen, eingeschleppt. Es werden fünf Genotypen (A-E) unterschieden, die bei europäischen Krebsen eine unterschiedliche Virulenz aufweisen. Die derzeit am FIWI angewandte Diagnostik ist in ihrer Sensitivität begrenzt und kann nicht zwischen Genotypen unterscheiden. Eine neu entwickelte Methode hat nun das Potenzial, die Sensitivität zu steigern und eine Genotypisierung zu ermöglichen. Ziel des vorgeschlagenen Projekts ist somit die Optimierung / Ergänzung der derzeit am FIWI angewandten Diagnostik durch Etablierung modernster Methoden zur Identifizierung von A. astaci -Genotypen. Das Wissen über Verteilung von Genotypen wird zum Verständnis von Verbreitungsszenarien beitragen und Vorhersagen über mögliche Ausbrüche, deren Folgen und eine molekulare Epidemiologie der Krankheit in der Schweiz ermöglichen.

Textes supplémentaires

Abstract

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Projektziele

Schlüsselwörter

Krebspest, Meldepflichtige Seuche, Schweiz, real-time PCR, Genotypisierung, Nanopore basierte Sequenzierung, eDNA, Populationsdynamik

Participants

Heike Schmidt-Posthaus

Hauptgesuchstellung

heike.schmidt@unibe.ch

Centre for Fish and Wildlife Health Department of Infectious Diseases and Pathobiology Heike Schmidt-Posthaus Länggasstrasse 122 3012 Bern BE CH

Gary Delalay

Kontaktperson

gary.delalay@blv.admin.ch

Bundesamt f. Lebensmittelsicherheit und Veterinärwesen Gary Delalay Schwarzenburgstr. 155 3003 Bern BE CH

Irene Adrian-Kalchhauser

Mitgesuchstellung

Irene.adrian-kalchhauser@vetsuisse.unibe.ch

Centre for Fish and Wildlife Health Department of Infectious Diseases and Pathobiology Irene Adrian-Kalchhauser Länggasstrasse 122 3012 Bern BE CH

Détails du projet

Office de recherche
BLV
Statut du projet
Abgeschlossen
Type de projet
Forschungsprojekt
Date de début
2021-02-28
Date de fin
2023-04-29
Coûts totaux approuvés
-
Section
Tiergesundheit, Zoonosen
Domaine politique NABS
Landwirtschaftliche Produktivität und Technologie

Labels

erledigt definitiv Monitoring und Surveillance Bekämpfung und Kontrolle

Disciplines de recherche

  • B725 Diagnostics 100.0%